Cụ thể, mục tiêu đến năm 2025, về ứng dụng CNTT, chuyển đổi số y tế, phấn đấu 100% văn bản đi, đến được cập nhật, xử lý trên môi trường mạng (trừ văn bản mật). 100% hồ sơ tiếp nhận tại bộ phận một cửa được cập nhật vào phần mềm một cửa. 100% ý kiến chỉ đạo được theo dõi và xử lý trên mạng... Về ứng dụng CNTT và chuyển đổi số y tế phục vụ cán bộ, người dân và doanh nghiệp, phấn đấu 100 % TTHC được mức độ 3 và trên 95% mức độ 4.  Tỷ lệ hồ sơ giải quyết theo dịch vụ công trực tuyến mức độ 4 trên tổng số hồ sơ đạt từ 90% trở lên và 100% mức độ 3; tối thiểu 95% người dân và doanh nghiệp hài lòng về việc giải quyết thủ tục hành chính. Tích hợp, kết nối các dịch vụ về theo dõi, chăm sóc sức khỏe, tư vấn sức khỏe, cảnh báo dịch bệnh vào ứng dụng HUE-S... Đối với mục tiêu phát triển an toàn thông tin, phấn đấu nghiên cứu các sản phẩm dịch vụ an toàn thông tin để đưa vào khai thác vận hành nhằm tăng cường năng lực thực hiện công tác đảm bảo an toàn thông tin có chất lượng cao. Đẩy mạnh công tác đào tạo, huấn luyện, phát triển nguồn nhân lực an toàn thông tin. Triển khai tuyên truyền, phổ biến nâng cao nhận thức và trách nhiệm của cán bộ công chức, viên chức về vai trò và tầm quan trọng của việc đảm bảo an toàn thông tin.

Mục tiêu đến năm 2030, phấn đấu duy trì 100% các chỉ tiêu giai đoạn 2021-2025, bao gồm các chỉ tiêu duy trì: phát triển Chính phủ số trong y tế, phát triển xã hội số trong y tế, các chỉ tiêu trong phòng bệnh và chăm sóc sức khỏe nhân dân. 100% hệ thống thông tin y tế kết nối, chia sẻ qua nền tảng tích hợp dữ liệu y tế. 100% đơn vị khám chữa bệnh hạng 2 trở lên và 80% đơn vị khám chữa bệnh hạng 3 triển khai bệnh án điện tử.

Trên cơ sở những nhiệm vụ cần thực hiện để đạt được các mục tiêu đã đề ra. Trong đó, bảo đảm khai thác triệt để hạ tầng kỹ thuật, các hệ thống thông tin và cơ sở dữ liệu lớn, đồng thời bảo đảm sự kết nối giữa các hệ thống thông tin, bảo đảm tuân thủ Khung Kiến trúc Chính phủ điện tử, triển khai bảo đảm an toàn thông tin theo mô hình 4 lớp. Cụ thể, Kế hoạch bao gồm những nhiệm vụ trọng tâm sau: Hướng dẫn, triển khai để hoàn thiện môi trường pháp lý; Về hạ tầng kỹ thuật; Triển khai cơ sở dữ liệu và ứng dụng công nghệ thông tin;  Đảm bảo an toàn, an ninh thông tin trên môi trường mạng; Nguồn nhân lực; Công tác truyền thông và thi đua khen thưởng.